องค์การบริหารส่วนจังหวัดพะเยา แบ่งโครงสร้างออกเป็น 2 ส่วน คือ

                       1. ฝ่ายนิติบัญญัติ คือ ฝ่ายสภาองค์การบริหารส่วนจังหวัดพะเยา ประกอบด้วยสมาชิกที่มาจากการเลือกตั้งของประชาชน จำนวน
36 คน โดย มีวาระการดำรงตำแหน่ง 4 ปี มีประธานสภาองค์การบริหารส่วนจังหวัดจำนวน 1 คน เป็นผู้ดูแลควบคุม และรองประธานสภาฯจำนวน 2 คน
เป็นผู้ช่วยประธานและรองประทานได้จาก การคัดเลือกของสมาชิกสภาองค์การบริหารส่วนจังหวัดพะเยา

อำนาจหน้าที่ของสภาองค์การบริหารส่วนจังหวัด
                              1. อำนาจหน้าที่ในทางนิติบัญญัติ ได้แก่การพิจารณากลั่นกรองร่างข้อบัญญัติองค์การบริหารส่วนจังหวัด และการอนุมัติ
ข้อบัญญัติองค์การบริหารส่วนจังหวัดชั่วคราวที่บังคับใช้ได้แก่ประชาชนที่อยู่ในเขต องค์การบริหารส่วนจังหวัดโดยเฉพาะที่สำคัญ คือ อำนาจในการ
พิจารณาข้อบัญญัติงบประมาณรายจ่ายที่นายกองค์การบริหารส่วนจังหวัดเสนอ
                               2. อำนาจหน้าที่ในการตรวจสอบติดตามกำกับดูแลการปฏิบัติงานของฝ่ายบริหาร ซึ่งได้แก่การอภิปรายในสภา การลงมติ
ในเรื่องต่างๆ เพื่อให้ฝ่ายบริหารปฏิบัติการตั้งกระทู้ถามฝ่ายบริหารเกี่ยวกับงานขององค์การบริหารส่วนจังหวัด รวมทั้งยังสามารถที่จะเสนอปัญหา
ทุกข์สุขของราษฎร ให้ฝ่ายบริหารได้ทราบ เพื่อพิจารณาดำเนินการแก้ไข

                      2.   ฝ่ายบริหาร  นายกองค์การบริหารส่วนจังหวัด เป็นผู้ดูแลควบบคุมในฝ่าย นายกองค์การบริหารส่วนจังหวัดได้จากการเลือกตั้ง
และการลงคะแนนของพี่น้องประชาชนชาวจังหวัดพะเยาจำนวน 1 คน มีวาระการดำรงตำแหน่ง 4 ปี นอกจากนี้นายกองค์การบริหารส่วนจังหวัด มีอำนาจ
แต่งตั้งสมาชิกสภาองค์การบริหารส่วนจังหวัดเป็นรองนายกองค์การบริหารส่วนจังหวัด ตามสัดส่วนจำนวนสมาชิกสภาองค์การบริหารส่วนจังหวัดซึ่ง
จังหวัดพะเยามีสมาชิกสภาฯ 36 คน จึงมีรองนายกองค์การบริหารส่วนจังหวัด จำนวน 2 คน